| 子大会名 | 開始日 | 終了日 | 参加チーム・選手 | 備考 | 審判 |
| Aグループ（A組） | 2012/08/14 | 2012/08/15 | Ｓ広島ユース, 市立船橋, 中京大中京, 大社 | | ■ |
| Bグループ（B組） | 2012/08/14 | 2012/08/15 | Ａ福岡ユース, 湘南Ｂユース, 浜松開誠館, 鹿児島城西 | | ■ |
| Cグループ（C組） | 2012/08/14 | 2012/08/15 | Ｖ仙台ユース, 東福岡, 広島皆実, 奈良育英 | | ■ |
| Ｄグループ（D組） | 2012/08/14 | 2012/08/15 | 愛媛ＦＣユース, 作陽, 四日市中央工業, 立正大淞南 | | ■ |
| 予選3位チーム（9から12位）戦 | 2012/08/14 | 2012/08/16 | 大社, 鹿児島城西, 広島皆実, 四日市中央工業, 大社, 四日市中央工業, 鹿児島城西, 広島皆実 | | ■ |
| 予選4位チーム（13から16位）戦 | 2012/08/15 | 2012/08/15 | 中京大中京, 湘南Ｂユース, 奈良育英, 愛媛ＦＣユース, 中京大中京, 愛媛ＦＣユース, 湘南Ｂユース, 奈良育英 | | ■ |
| 決勝トーナメント | 2012/08/14 | 2012/08/16 | Ｓ広島ユース, 市立船橋, Ａ福岡ユース, 浜松開誠館, Ｖ仙台ユース, 東福岡, 作陽, 立正大淞南 | | ■ |
| 準々決勝敗者（５～８位）戦 | 2012/08/16 | 2012/08/16 | 作陽, Ｖ仙台ユース, 立正大淞南, 東福岡 | | ■ |
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